ومن ثم فإن الدراسات السريرية تظهر أن الأمراض السرطانية في الخلايا الحرشفية، وفي البلعوم، وكذلك الأورام السرطانية المتعلقة بالجيوب في الوجه من دواعي الاستعمال التي قد تستفيد من العلاج بالبروتونات من حيث الفعالية العلاجية أو انخفاض السميات الحادة والمتأخرة. يجب مناقشة دواعي الاستعمال هذه بشكل مسبق في الاجتماع التشاوري متعدد التخصصات (RCP). تجري هذه المعالجات في إطار التجارب البحثية السريرية.